蔡崔源，嘉義廳嘉義街（今嘉義市）人，1905年5月生，祖籍福建省漳州府平和縣，家居南門外，今南門街近垂揚路處，蔡丁與陳碧之長子，家營經銷商，於兒女教育極為熱心。蔡崔源七歲時於嚴本林漢學書房啟蒙，八歲時入學於嘉義公學校（今嘉義市立崇文國民小學），十四歲畢業，再考入嘉義公學校實業科。1919年烏山頭水庫動工，由八田與一技師設計監工，同年臺灣總督府創辦公立嘉義農林學校（今國立嘉義大學）於山仔頂（今國立嘉義高級商業職業學校校址），用以培養本土農業人才，蔡崔源實業科入學甫一年未畢業即考取嘉農農業科，為第一屆學生。二年級時加入校網球隊，與校長柳川鑑藏同隊。嘉農於1921年改名臺南州立嘉義農林學校，蔡崔源則於1922年3月畢業。因父母不忍其離鄉升學，乃仰體親意，憑媒妁之言與林展於畢業前夕結褵成家，復得柳川鑑藏之推薦，進入公共埤圳嘉南大圳組合調查課任職，由雇員起用，從事農業經濟調查及水利建設基礎工作，公餘則從嘉義廳參事前清嘉義玉峰書院山長張元榮習漢學，惜因經常出差，年餘即中輟。
1930年5月，嘉南大圳烏山頭水庫竣工，蔡崔源以技手捕職等調派北門郡部水利係，次年3月出任子良廟灌溉監視所主任，1933年8月調任七股灌溉監視所主任並升任技手，負責鹽分地改良工程，初期鄉人並不信任蔡崔源能力，多人索性賣地予總爺製糖會社。蔡崔源乃向總爺製糖會社借地六甲，親自從事蓬萊米栽種實驗而獲得成功，使土地改良事業得以順利展開。在此之外，其則亦進行粗放式輪流灌溉試驗及農事共同作業、共同秧田之推行。1937年參與北門郡耕地防風林造成組合，1940年3月，升監視員，1943年以〈稻作統制植付之目的及方法〉論文獲得臺灣水利組合聯合會臺南州支部參等獎。次年調任安溪寮灌溉監視所主任，從事看天田黏土地之改良。
1945年8月日本向同盟國投降，12月中華民國國民政府接收臺灣，蔡崔源受臺南縣政府委派出任嘉南大圳水利組合接收委員，負責水利課及其所轄一百三十八個管理站接收事宜，1946年2月接收完畢，升任技師並代理水利課長，8月真除，其主要工作為嘉南平原十五萬公頃土地之灌溉、排水管理、土地改良、水稻輪流灌溉試驗等。在日本技術與管理人員全部被遣返回國之後，年方四十歲的蔡崔源一夕之間突然有了大顯身手的機會，從臺南縣安溪寮的一角走出，在嘉南平原馳驅，負責領導臺灣本土年輕和原本低階的水利工程人員，全力恢復太平洋戰爭以前嘉南大圳的機能。
1947年2月，二二八事件爆發，3月5日，臺南市成立二二八事件處理委員會臺南分會，推舉前日本臺南市警察署司法主任湯德章出任治安組組長，維持市面平靜。高雄要塞國民革命軍於11日開抵臺南後，即於民生綠園公開槍決湯德章示眾。蔡崔源對湯德章遭遇充滿同情，內心深受震撼，從此告誡家人不得參與政治，並絕口不談論政治。
1947年4月，嘉南大圳水利組合改組為嘉南大圳農田水利協會，蔡崔源升技正，任水利科長，1948年4月嘉南大圳農田水利協會再改組為嘉南大圳水利委員會，升工程師任灌溉課長，1952年7月至9月一度兼設計課長。時中華民國兩百萬軍民一時湧入人口六百萬的臺灣，嘉南平原糧食供應壓力遽增，但臺灣卻從未出現糧荒，且農業生產於1952年超過戰前最高水準。
1953年起臺灣數年大旱，常年缺雨逾一百四十天，蔡崔源令烏山頭水庫實施間斷放水灌溉、濁幹線系統支分線輪流放水，均告成功，當年農作竟因日照水量皆足而大收。全國僅嘉南克服缺水災情，且五穀豐登，蔡崔源乃因此聲譽雀起，深受賞識。時臺灣省政府建設廳為因應全省抗旱需要，成立臺灣省輪流灌溉推進委員會，即邀請蔡崔源出任推行小組組員，並督導中營灌溉研究工作站，以嘉南經驗為基礎，研發並建立水資源有效營運機制。蔡崔源乃將其經驗心得整理為《輪流灌溉實務》一書出版。1955年及1956年臺灣接連大旱，皆賴輪灌得以克服難關，證明蔡崔源方法奏效。嘉南平原自古屢興水荒，早在清同治年間，臺南府即曾諭告，命屬縣輪番灌溉。日據時期，八田與一建立三年輪作式灌溉制度，即令同一土地，以三年為期輪番栽種稻米、甘蔗、雜作。蔡崔源則精神紹繼八田與一，自行建立灌溉動態配水流程作業，即依試驗所得數據，進一步就各乾濕田地之最適灌溉週期（輪距）依序作精密輪流灌溉，使水資源在適量適時的科學管理下發揮最大效用，而田地也因分種分區輪替運用，保護肥分不致流失，使農作物之收成量得以大幅提高。嘉南平原的農業生產，乃成為戰後臺灣經濟的火車頭，支應臺灣的重建，並作為原始積累用以發展工商業，逐步造就出臺灣經濟的富裕。
1956年3月，蔡崔源調任代管理組長，12月，嘉南大圳水利委員會改組為嘉南農田水利會，1957年9月真除管理組長職，11月，《輪流灌溉實務》一書獲得中國水利工程學會年度論文獎勵乙獎。因嘉南輪灌及水利經營經驗名聞遐邇，東南亞各國紛紛派員來臺取經，為應各國技術人員研習之需要，《輪流灌溉實務》乃再迻譯為英文Rotational Irrigation Practice出版。而鑑於雲林地區缺水問題難以處理，1960年起，蔡崔源則在國立臺灣大學農業工程學系技術指導下，進行旱作物灌溉試驗，並訂定〈獎勵旱種早收方案〉加以推廣，使地利充分發揮，此後徹底根絕搶水糾紛。
1961年1月，蔡崔源出版《臺灣農田水利經營》，1962年由行政院美援運用委員會〈美援技術協助計劃〉保送赴美內政部墾務局考察灌溉管理，1963年借調石門大圳管理處灌溉規劃小組任召集人。石門大圳與石門水庫工程，係1956年動工、1964年6月完工者，為八田與一〈昭和水利計劃〉未完成的部份，而由蔡崔源主持規劃完成其灌溉系統，其範圍涵蓋桃園龍潭、平鎮及今新竹工業園區。為嘉南平原開發新水源，1967年曾文水庫動工，1973年完成，與烏山頭水庫串聯運轉，蔡崔源出任曾文水庫完成後灌溉管理營運之籌劃與執行小組召集人，參與規劃而建構完成嘉南大圳當前所見的規模。
蔡崔源為子女擇偶婚配，儘量遠避政治，1952年有人有意媒合某臺灣省立臺南工學院畢業生與其三女蔡麗瑛，蔡崔源聞該人曾於二二八期間參與學運而否決，1965年為選中之三女婿國立臺灣大學法學院畢業生曾群芳則始終未承認參與過學運。
蔡崔源於1971年8月升管理師，兼任代理總幹事職務，同年出版《灌溉管理》一書，次年2月起專司總幹事。蔡崔源在嘉南農田水利會一生奮鬬，事功與立說於此達到人生巔峰。時日本京都大學農業工程學系教授富士岡義一曾擬安排其赴日本該校農學部大學院深造，惜此議因蔡崔源未具大學學士學歷以及富士岡義一驟逝而作罷。蔡崔源終於在1974年12月31日榮退，總計五十三年終身奉獻於嘉南大圳，足跡遍及雲林縣、嘉義縣市、臺南縣市五縣市共五十庄十五萬公頃土地，對水資源精密計算掌握和有效運用管理，同時完成境內一萬六千公頃重黏地、兩萬四千公頃重鹽地、兩千公頃砂礫地之土地改良，使嘉南平原一片綠蔭，臺灣人人得以豐衣足食。
蔡崔源平生最為推崇前人八田與一，亦以八田傳人自許，惟其與嘉南農田水利會本土工作團隊的努力與成就，始真正代表臺灣人的光榮。
蔡崔源公餘喜在家以盆栽、書法和聽戲自娛，退休後則生活漸失重心。1985年1月8日妻林展病逝，蔡崔源骨刺手術復又失敗，身心自此消沉而於1989年2月18日於臺南市健康路退休後自購住宅病逝，享年八十四歲。遺體火化後與林展長眠竹溪寺。臥病時曾因三女長子即長外孫於《文星雜誌》發表文章批評中國國民黨校園佈建而告誡再三。1989年5月，熱衷學生運動之長外孫考取國立政治大學三民主義研究所，同樣告誡家人不得參與政治之三女婿曾群芳深感命運弄人，始向妻家透露昔日參與臺北二二八學生軍起義及中國共產黨地下組織情事。
民國九十八年六月二十八日五時於臺北晴園
民國九十八年七月一日九時校正
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